Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB2P29033 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB2P29033 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB2P29033 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB2P29033 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB2P29033 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB2P29033 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB2P29033 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB2P29033 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB2P29033 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB2P29033 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB2P29033 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB2P29033 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB2P29033 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB2P29033 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB2P29033 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB2P29033 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB2P29033 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB2P29033 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB2P29033 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB2P29033 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB2P29033 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB2P29033 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB2P29033 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB2P29033 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB2P29033 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB2P29033 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB2P29033 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB2P29033 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB2P29033 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB2P29033 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB2P29033 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB2P29033 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB2P29033 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB2P29033 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB2P29033 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB2P29033 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB2P29033 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB2P29033 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB2P29033 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB2P29033 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB2P29033 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB2P29033 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB2P29033 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB2P29033 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB2P29033 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB2P29033 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB2P29033 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB2P29033 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB2P29033 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB2P29033 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB2P29033 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB2P29033 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GJB2P29033 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJB2P29033 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJB2P29033 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJB2P29033 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJB2P29033 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJB2P29033 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJB2P29033 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJB2P29033 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJB2P29033 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJB2P29033 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJB2P29033 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJB2P29033 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJB2P29033 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJB2P29033 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GJB2P29033 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GJB2P29033 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GJB2P29033 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJB2P29033 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GJB2P29033 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GJB2P29033 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GJB2P29033 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GJB2P29033 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJB2P29033 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJB2P29033 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GJB2P29033 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJB2P29033 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJB2P29033 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJB2P29033 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJB2P29033 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GJB2P29033 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJB2P29033 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJB2P29033 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJB2P29033 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJB2P29033 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJB2P29033 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJB2P29033 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJB2P29033 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJB2P29033 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GJB2P29033 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJB2P29033 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJB2P29033 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJB2P29033 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJB2P29033 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJB2P29033 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GJB2P29033 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GJB2P29033 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GJB2P29033 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms