Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW3

SMIM10L1, Small integral membrane protein 10-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L1P0DMW3 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SMIM10L1P0DMW3 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms