Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
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