Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms