Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CHPF2Q9P2E5 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms