Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 IKZF1-201ENST00000331340 6189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 DYSF-203ENST00000409366 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 BSDC1-201ENST00000341071 4599 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 PTGER3-206ENST00000370924 6982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 AP002008.2-201ENST00000635926 4870 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 OTOF-204ENST00000402415 5108 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 PSMD11-201ENST00000261712 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 GPR158-201ENST00000376351 6959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 TMEM170A-201ENST00000357613 4959 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 NCAM1-225ENST00000618266 5937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 DRAXIN-201ENST00000294485 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 FMNL1-202ENST00000331495 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 HERC2P3-204ENST00000426501 5995 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 REST-208ENST00000619101 7114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 GZF1-202ENST00000377051 4740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 TNFAIP3-206ENST00000612899 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 EIF4E3-205ENST00000448225 6209 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 PDP2-201ENST00000311765 7146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 CASC4-202ENST00000345795 3764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC8.49□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
RETNLBQ9BQ08 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms