Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 RANGRF-201ENST00000226105 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 AC136475.7-201ENST00000602949 592 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 OR5L1-201ENST00000625203 1110 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 ANAPC15-203ENST00000502597 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 LINC01744-201ENST00000457698 2042 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SIRT1Q96EB6 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 POLR2F-202ENST00000405557 560 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 AL357079.1-203ENST00000412378 494 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 LINC00484-201ENST00000414768 561 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 FAM90A28P-201ENST00000596881 489 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 AL035427.1-201ENST00000602441 387 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 POLR2F-213ENST00000606538 760 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 AC026271.1-201ENST00000447794 1348 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 CCDC42-201ENST00000293845 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 AC012358.2-201ENST00000430010 1434 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 HIST2H2BE-201ENST00000369155 2194 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 CMTM5-204ENST00000382809 378 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 DNM1P46-202ENST00000415963 882 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 RBMX2P5-201ENST00000424312 969 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 RAB34-211ENST00000450529 1184 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 ARHGEF26-AS1-203ENST00000480639 582 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 RNA5SP288-201ENST00000516075 93 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 SLC25A51P3-201ENST00000521814 889 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 AC005096.1-201ENST00000560499 622 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 ERAS-202ENST00000636362 826 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 ECI2-207ENST00000465828 1548 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms