Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6P435 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q6P435 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q6P435 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q6P435 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q6P435 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q6P435 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q6P435 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q6P435 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q6P435 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q6P435 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q6P435 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q6P435 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q6P435 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q6P435 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q6P435 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q6P435 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q6P435 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q6P435 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Q6P435 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q6P435 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q6P435 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Q6P435 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q6P435 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q6P435 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q6P435 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q6P435 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q6P435 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q6P435 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q6P435 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q6P435 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q6P435 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q6P435 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Q6P435 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Q6P435 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q6P435 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q6P435 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q6P435 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q6P435 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q6P435 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q6P435 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q6P435 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Q6P435 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Q6P435 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q6P435 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q6P435 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Q6P435 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121 ms