Protein–RNA interactions for Protein: Q1X8D7

LRRC36, Leucine-rich repeat-containing protein 36, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC36Q1X8D7 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 KCNAB1-215ENST00000618897 4437 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 POC1B-GALNT4-202ENST00000548729 5436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 INTS6L-201ENST00000370752 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 CACNA1C-209ENST00000399603 7377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 FERMT2-201ENST00000341590 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 CCDC114-201ENST00000315396 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 CC2D1A-208ENST00000589606 3117 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 UBTF-206ENST00000527034 3010 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 SYTL4-201ENST00000263033 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 AL391294.1-201ENST00000641352 4068 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 ATP1A1-201ENST00000295598 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 DZIP1L-201ENST00000327532 3493 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 TMEM136-202ENST00000375095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 DUSP11-202ENST00000443070 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 BSCL2-206ENST00000405837 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 ABCC4-207ENST00000629385 2903 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 DENND1C-201ENST00000381480 2816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 PNPLA7-202ENST00000406427 4806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 POLR3E-219ENST00000615879 3655 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 AL354861.3-201ENST00000600140 2412 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 MSH6-215ENST00000622629 4324 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 COX7A2L-202ENST00000378669 3056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 AC092139.4-201ENST00000624318 2794 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 ATXN10-201ENST00000252934 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 TEX35-203ENST00000367641 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 DAPK1-201ENST00000358077 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 ZNF341-201ENST00000342427 3661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 AHI1-205ENST00000457866 5549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 F2RL3-201ENST00000248076 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LRRC36Q1X8D7 AL357060.2-202ENST00000606998 1959 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms