Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 SIGLEC17P-204ENST00000618545 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 FAM25A-201ENST00000343959 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 AP000346.2-202ENST00000425948 383 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 PLAC9P1-203ENST00000440031 223 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 COL18A1-AS2-201ENST00000446475 552 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 PRDX3P2-201ENST00000447051 611 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 CDHR4-205ENST00000487256 1017 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 SKINT1L-204ENST00000604015 540 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 AC092687.3-201ENST00000606907 393 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 AC006273.1-201ENST00000606966 861 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 ARF4-201ENST00000303436 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 SCGB1C1-201ENST00000342878 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 CRCT1-201ENST00000368790 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 MIR766-201ENST00000390223 111 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 RN7SL76P-201ENST00000482435 289 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 AC079340.2-201ENST00000504957 495 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 BBOX1-AS1-203ENST00000530430 879 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 BBOX1-AS1-204ENST00000531363 745 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 TMEM106A-201ENST00000536052 1181 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 AL139317.2-201ENST00000556998 158 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 AC073254.1-209ENST00000604677 631 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 SRL-202ENST00000537996 1814 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 ECH1-201ENST00000221418 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 DHRSX-IT1-201ENST00000437244 651 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 AL583804.1-201ENST00000448643 810 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 SMIM14-205ENST00000511809 830 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 AC092656.1-202ENST00000515843 998 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 TATDN3-208ENST00000526997 794 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 TATDN3-213ENST00000531963 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 AC005920.4-201ENST00000573301 492 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 AL033381.2-201ENST00000603854 732 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 Metazoa_SRP.152-201ENST00000614413 286 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 Metazoa_SRP.47-201ENST00000616942 279 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 AC112702.1-201ENST00000623712 366 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 GLDC-216ENST00000639639 1559 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 GAPDH-205ENST00000396861 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 HRASLS2-201ENST00000255695 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 BNIP1-202ENST00000351486 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 RAB42P1-201ENST00000555078 316 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 AC079336.3-201ENST00000577227 475 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 SLC26A5-203ENST00000354356 2686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GAPVD1Q14C86 SGCA-202ENST00000344627 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
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