Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 NFATC2IP-206ENST00000568148 1157 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 SLC13A4-201ENST00000354042 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 LOXL3-204ENST00000409549 2897 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 AC068580.3-201ENST00000449248 2015 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 ARHGEF9-226ENST00000636392 1920 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 IP6K3-201ENST00000293756 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 IFT122-204ENST00000349441 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 C12orf76-205ENST00000548191 2204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 VWA5B2-201ENST00000273794 3486 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 CNTROB-203ENST00000565740 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 GLO1-201ENST00000373365 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 PAX3-205ENST00000392069 3170 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 LINC01024-201ENST00000499203 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 TSN-201ENST00000389682 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 USP2-AS1-202ENST00000500970 1784 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CCNIQ14094 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms