Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 AL031590.1-202ENST00000641466 1737 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 MIR1226-201ENST00000408658 75 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 AC106789.1-201ENST00000512927 570 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 RN7SL33P-201ENST00000462543 342 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 RPL10P8-201ENST00000522888 313 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 AP001107.9-202ENST00000531602 613 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 GLT8D2-204ENST00000547583 862 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 TMEM230-211ENST00000615008 594 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 RPL18AP15-201ENST00000430258 517 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 AC078882.1-201ENST00000436132 416 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 HMOX2-213ENST00000575120 1027 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 RPL26-209ENST00000584164 873 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 NRSN2-206ENST00000608736 712 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 CYP2B6-202ENST00000593831 1426 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 DDX11L8-201ENST00000535849 366 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 AL078624.1-201ENST00000604004 547 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 AC092687.3-201ENST00000606907 393 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 NCS1-203ENST00000630865 1092 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNA1SQ13698 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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