Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 PTGR2-205ENST00000555661 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 GDPD2-205ENST00000538649 2067 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 RASAL1-203ENST00000446861 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 ZMIZ2-215ENST00000615423 2772 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 TMCC2-208ENST00000545499 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 IGSF11-202ENST00000393775 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 DIO1-216ENST00000613679 1856 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 RHOH-222ENST00000617441 1872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 SPAG8-201ENST00000340291 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 CLINT1-206ENST00000523094 3987 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 ANKRD27-204ENST00000587352 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 PHC2-203ENST00000373422 2799 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 SPRTN-202ENST00000295050 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 MIGA2-201ENST00000358369 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 YY1AP1-205ENST00000355499 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 SDR16C5-203ENST00000522671 1988 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 CEACAM20-206ENST00000621342 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 DDB2-201ENST00000256996 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 ZSCAN21-205ENST00000543588 1870 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 TXNRD1-201ENST00000354940 4082 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 LINC02228-202ENST00000641261 2489 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 GOLGA1-202ENST00000373555 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 LINC01134-202ENST00000439488 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 KRI1-201ENST00000312962 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 PJA1-204ENST00000374584 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 RAP1A-202ENST00000369709 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
LSAMPQ13449 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 USP11-204ENST00000377107 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 WDR43-202ENST00000407426 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 AKAP1-208ENST00000572557 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 ITGAX-201ENST00000268296 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 OSBPL7-202ENST00000392507 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 C10orf76-202ENST00000370033 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 PAK1-215ENST00000530617 3001 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
LSAMPQ13449 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
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