Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 MYLK-204ENST00000360304 7738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
IFFO1Q0D2I5 TMEM246-202ENST00000374848 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 KIAA0319-205ENST00000543707 5314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 GPR161-209ENST00000539777 7655 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 CAMKK2-205ENST00000392474 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 KCNAB2-202ENST00000341524 4207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 ADARB1-214ENST00000629643 4583 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 CD38-201ENST00000226279 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 MYRIP-201ENST00000302541 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 LRRN2-201ENST00000367175 5036 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 MYO1C-202ENST00000361007 4734 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 RPS6KC1-209ENST00000615329 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 USP33-203ENST00000370793 4502 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 RBM15-201ENST00000369784 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
IFFO1Q0D2I5 SLC6A19-201ENST00000304460 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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