Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 ASB7-201ENST00000332783 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 CAMKK2-205ENST00000392474 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 P2RY8-201ENST00000381297 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 MYO1C-202ENST00000361007 4734 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 TRUB2-201ENST00000372890 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 ATL2-204ENST00000406122 2864 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 SNIP1-201ENST00000296215 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 CBL-201ENST00000264033 11231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 PCDHGA8-202ENST00000610569 6480 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 POC1B-GALNT4-202ENST00000548729 5436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 SYNRG-229ENST00000621136 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 PLEKHG3-201ENST00000247226 10351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 ROBO2-209ENST00000487694 5919 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 SIGLEC1-201ENST00000344754 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 RBM15-201ENST00000369784 4244 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms