Protein–RNA interactions for Protein: P52803

EFNA5, Ephrin-A5, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA5P52803 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA5P52803 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA5P52803 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA5P52803 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA5P52803 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA5P52803 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA5P52803 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA5P52803 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA5P52803 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA5P52803 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA5P52803 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA5P52803 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA5P52803 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA5P52803 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA5P52803 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA5P52803 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA5P52803 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA5P52803 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA5P52803 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA5P52803 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA5P52803 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA5P52803 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNA5P52803 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA5P52803 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA5P52803 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA5P52803 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA5P52803 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA5P52803 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA5P52803 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA5P52803 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA5P52803 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA5P52803 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA5P52803 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA5P52803 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA5P52803 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA5P52803 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA5P52803 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA5P52803 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA5P52803 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA5P52803 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA5P52803 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA5P52803 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA5P52803 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA5P52803 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA5P52803 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA5P52803 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA5P52803 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA5P52803 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA5P52803 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA5P52803 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFNA5P52803 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA5P52803 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA5P52803 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA5P52803 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA5P52803 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA5P52803 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA5P52803 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA5P52803 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA5P52803 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA5P52803 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA5P52803 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA5P52803 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA5P52803 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA5P52803 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA5P52803 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA5P52803 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EFNA5P52803 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA5P52803 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA5P52803 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA5P52803 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA5P52803 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA5P52803 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA5P52803 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA5P52803 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA5P52803 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA5P52803 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA5P52803 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA5P52803 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA5P52803 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA5P52803 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA5P52803 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA5P52803 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA5P52803 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA5P52803 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA5P52803 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA5P52803 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA5P52803 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA5P52803 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA5P52803 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA5P52803 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA5P52803 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA5P52803 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA5P52803 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA5P52803 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA5P52803 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA5P52803 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA5P52803 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA5P52803 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA5P52803 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EFNA5P52803 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms