Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCR5P32302 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCR5P32302 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCR5P32302 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCR5P32302 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCR5P32302 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCR5P32302 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCR5P32302 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCR5P32302 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCR5P32302 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCR5P32302 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCR5P32302 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCR5P32302 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCR5P32302 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCR5P32302 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCR5P32302 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCR5P32302 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCR5P32302 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCR5P32302 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCR5P32302 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCR5P32302 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCR5P32302 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCR5P32302 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCR5P32302 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCR5P32302 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCR5P32302 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCR5P32302 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCR5P32302 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCR5P32302 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCR5P32302 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCR5P32302 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCR5P32302 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms