Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
OTX2P32243 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OTX2P32243 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
OTX2P32243 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OTX2P32243 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OTX2P32243 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
OTX2P32243 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OTX2P32243 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
OTX2P32243 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OTX2P32243 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
OTX2P32243 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OTX2P32243 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OTX2P32243 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OTX2P32243 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
OTX2P32243 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
OTX2P32243 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
OTX2P32243 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OTX2P32243 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OTX2P32243 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OTX2P32243 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OTX2P32243 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OTX2P32243 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
OTX2P32243 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OTX2P32243 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
OTX2P32243 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
OTX2P32243 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
OTX2P32243 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
OTX2P32243 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
OTX2P32243 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
OTX2P32243 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
OTX2P32243 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
OTX2P32243 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OTX2P32243 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
OTX2P32243 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
OTX2P32243 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
OTX2P32243 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
OTX2P32243 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
OTX2P32243 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
OTX2P32243 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
OTX2P32243 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
OTX2P32243 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
OTX2P32243 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
OTX2P32243 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
OTX2P32243 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
OTX2P32243 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
OTX2P32243 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
OTX2P32243 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
OTX2P32243 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
OTX2P32243 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.9 ms