Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CCNA2P20248 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CCNA2P20248 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
CCNA2P20248 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNA2P20248 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNA2P20248 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNA2P20248 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNA2P20248 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNA2P20248 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNA2P20248 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CCNA2P20248 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNA2P20248 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CCNA2P20248 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CCNA2P20248 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNA2P20248 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNA2P20248 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNA2P20248 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNA2P20248 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CCNA2P20248 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CCNA2P20248 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNA2P20248 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNA2P20248 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNA2P20248 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CCNA2P20248 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CCNA2P20248 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CCNA2P20248 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNA2P20248 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNA2P20248 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNA2P20248 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CCNA2P20248 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCNA2P20248 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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CCNA2P20248 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNA2P20248 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNA2P20248 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNA2P20248 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNA2P20248 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNA2P20248 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNA2P20248 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNA2P20248 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNA2P20248 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNA2P20248 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNA2P20248 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNA2P20248 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNA2P20248 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNA2P20248 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCNA2P20248 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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