Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CD28P10747 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CD28P10747 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CD28P10747 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CD28P10747 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CD28P10747 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CD28P10747 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CD28P10747 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CD28P10747 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CD28P10747 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CD28P10747 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CD28P10747 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CD28P10747 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CD28P10747 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CD28P10747 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD28P10747 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD28P10747 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD28P10747 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD28P10747 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD28P10747 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD28P10747 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD28P10747 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD28P10747 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD28P10747 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD28P10747 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD28P10747 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD28P10747 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD28P10747 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD28P10747 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD28P10747 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD28P10747 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD28P10747 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CD28P10747 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD28P10747 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD28P10747 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CD28P10747 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD28P10747 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD28P10747 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD28P10747 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD28P10747 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CD28P10747 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD28P10747 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CD28P10747 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD28P10747 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD28P10747 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD28P10747 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CD28P10747 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD28P10747 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD28P10747 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD28P10747 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD28P10747 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD28P10747 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD28P10747 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD28P10747 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD28P10747 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD28P10747 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD28P10747 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD28P10747 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD28P10747 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD28P10747 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD28P10747 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD28P10747 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD28P10747 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD28P10747 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD28P10747 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD28P10747 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD28P10747 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD28P10747 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD28P10747 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD28P10747 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD28P10747 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD28P10747 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD28P10747 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD28P10747 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD28P10747 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD28P10747 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD28P10747 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD28P10747 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD28P10747 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD28P10747 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD28P10747 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD28P10747 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD28P10747 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD28P10747 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD28P10747 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD28P10747 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD28P10747 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD28P10747 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD28P10747 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD28P10747 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CD28P10747 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CD28P10747 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD28P10747 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD28P10747 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CD28P10747 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD28P10747 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD28P10747 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CD28P10747 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD28P10747 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD28P10747 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms