Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LTAP01374 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LTAP01374 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LTAP01374 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LTAP01374 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LTAP01374 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LTAP01374 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LTAP01374 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LTAP01374 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LTAP01374 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LTAP01374 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LTAP01374 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LTAP01374 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LTAP01374 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LTAP01374 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LTAP01374 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LTAP01374 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LTAP01374 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LTAP01374 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LTAP01374 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LTAP01374 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LTAP01374 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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LTAP01374 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LTAP01374 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LTAP01374 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LTAP01374 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LTAP01374 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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LTAP01374 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LTAP01374 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LTAP01374 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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LTAP01374 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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LTAP01374 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 AL355336.1-201ENST00000451355 1676 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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