Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 MTHFD2P7-201ENST00000483867 983 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 STK16-202ENST00000409260 1493 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 UBIAD1-201ENST00000376804 825 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms