Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
C4orf47A7E2U8 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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C4orf47A7E2U8 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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C4orf47A7E2U8 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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C4orf47A7E2U8 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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C4orf47A7E2U8 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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C4orf47A7E2U8 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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C4orf47A7E2U8 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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C4orf47A7E2U8 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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C4orf47A7E2U8 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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C4orf47A7E2U8 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C4orf47A7E2U8 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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