Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 IL32-230ENST00000551122 733 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC007223.1-201ENST00000564076 572 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR4539-201ENST00000579784 60 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 MXRA7-204ENST00000585519 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 PACRG-AS3-204ENST00000620150 567 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF397-209ENST00000591206 1516 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 AKNA-203ENST00000312033 3334 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 GRP-201ENST00000256857 848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00388-201ENST00000412714 663 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALDOAP1-201ENST00000491506 1078 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 WASIR2-201ENST00000527434 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC099795.2-201ENST00000639582 440 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGHE-202ENST00000641420 1485 ntAPPRIS P5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPAG1-205ENST00000520508 1796 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPM3-204ENST00000323144 1088 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 SCGB1C1-201ENST00000342878 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRTAP4-6-201ENST00000345847 1055 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 CRYZL1-205ENST00000399442 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRDX2P3-201ENST00000515779 586 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 STMN4-203ENST00000519614 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAR1-IT1-201ENST00000525233 368 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL031768.1-201ENST00000606542 701 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 IFNAR2-201ENST00000342101 2606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 GAPDH-205ENST00000396861 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 FARS2-201ENST00000274680 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 S100A6-202ENST00000368720 673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 USMG5-205ENST00000369825 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 CACYBPP3-201ENST00000406011 625 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL357033.2-201ENST00000430184 739 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 C3orf84-201ENST00000432035 669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 CPA5-203ENST00000461828 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL794P-201ENST00000469816 280 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 CST7-201ENST00000480798 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT18P63-201ENST00000505463 979 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRPL51-205ENST00000543164 814 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRPL51-206ENST00000543703 441 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 AMHR2-204ENST00000550311 1787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR4763-201ENST00000581461 92 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 LIMD2-210ENST00000582055 509 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 CSH2-207ENST00000613718 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 TCP1-215ENST00000544255 1403 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLP1-202ENST00000525602 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL022725.1-201ENST00000436283 369 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRSS45-201ENST00000442359 687 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00299-203ENST00000444688 537 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL357140.1-201ENST00000454104 424 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAB6B-205ENST00000486858 880 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
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