Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLKQ9UBT6 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms