Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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PPARGC1AQ9UBK2 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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PPARGC1AQ9UBK2 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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PPARGC1AQ9UBK2 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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PPARGC1AQ9UBK2 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PPARGC1AQ9UBK2 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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