Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ST8SIA1-203ENST00000396037 9714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CTNNBIP1Q9NSA3 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms