Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLF1Q9BQI6 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms