Protein–RNA interactions for Protein: Q96P50

ACAP3, Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAP3Q96P50 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ACAP3Q96P50 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms