Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 ZNF747-201ENST00000252799 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 MKL1-210ENST00000614754 3917 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 GUCY2D-201ENST00000254854 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 PHF19-202ENST00000373896 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 MESD-201ENST00000261758 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 ARMCX2-202ENST00000330154 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 PNMA3-203ENST00000619635 3627 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 TNRC6B-203ENST00000402203 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 AC009123.1-202ENST00000565643 2551 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 CHRNA7-223ENST00000637033 3204 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 SYK-204ENST00000375754 5005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 ZNF564-201ENST00000339282 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 GK-203ENST00000378943 3707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 ARHGAP33-203ENST00000314737 3858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 NCDN-203ENST00000373253 3677 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 CLGN-201ENST00000325617 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 MARCH3-201ENST00000308660 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF148Q8N7C7 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms