Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

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Length 950 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 LMBR1L-201ENST00000267102 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 MUC20-205ENST00000447234 2589 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 ARPP21-213ENST00000428373 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 SLC26A6-204ENST00000383733 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 EXTL2-207ENST00000535414 3146 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 SNIP1-201ENST00000296215 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 CPNE1-201ENST00000317677 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 GAS8-201ENST00000268699 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 OCA2-202ENST00000354638 3186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 TMEM169-202ENST00000406027 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 SPOCK3-203ENST00000421836 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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CCDC80Q76M96 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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CCDC80Q76M96 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
CCDC80Q76M96 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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