Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 SLC16A7-203ENST00000547379 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 DMBX1-201ENST00000360032 2880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 NAV2-204ENST00000396087 7882 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 FAM131B-204ENST00000409578 4286 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 IGSF11-202ENST00000393775 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 AC008758.4-201ENST00000435033 2593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 AC137834.1-201ENST00000548184 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 DIP2C-205ENST00000634311 4961 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 ESR2-213ENST00000557772 5458 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 FANCC-202ENST00000375305 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 TMEM199-201ENST00000292114 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 EHD1-201ENST00000320631 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 MYRIP-201ENST00000302541 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 PAM-204ENST00000348126 3622 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 HSPA12A-201ENST00000369209 5722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 ZNF674-201ENST00000414387 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 P4HA1-201ENST00000263556 2844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 P4HA1-204ENST00000394890 2844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 LIG1-221ENST00000613670 3949 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 SLC5A11-202ENST00000424767 2399 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 ATG13-211ENST00000528494 2351 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 LRRN2-201ENST00000367175 5036 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 TXNRD1-201ENST00000354940 4082 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 C10orf76-202ENST00000370033 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 AC104590.1-202ENST00000558368 1921 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 GPR179-204ENST00000621958 7983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 LRRC15-201ENST00000347624 5883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 IKZF4-203ENST00000547167 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 CCT8-201ENST00000286788 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 ARHGAP30-201ENST00000368013 4394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 NLRP2-208ENST00000448584 3573 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 ENDOU-201ENST00000229003 2332 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 GABRR2-201ENST00000402938 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 AC009533.1-201ENST00000539757 3158 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 GALT-201ENST00000378842 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 SHMT2-205ENST00000553474 1765 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 RGL1-202ENST00000360851 4724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 MYO1C-202ENST00000361007 4734 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 RPS24-204ENST00000440692 2814 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 FAM156B-203ENST00000593751 2942 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 FAM156A-201ENST00000596733 2942 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 LRRC8A-201ENST00000259324 4619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
LINC01545Q5VT33 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 CHAT-202ENST00000339797 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 CHAT-204ENST00000395559 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms