Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CAVIN4Q5BKX8 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms