Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TDRD12Q587J7 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms