Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 FLNA-204ENST00000369856 8241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 SCN8A-209ENST00000627620 5943 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
RTL8BQ17RB0 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 ZNF398-201ENST00000426851 5268 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 INHBA-201ENST00000242208 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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RTL8BQ17RB0 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
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RTL8BQ17RB0 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
RTL8BQ17RB0 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
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