Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRJQ12913 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRJQ12913 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRJQ12913 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRJQ12913 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRJQ12913 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRJQ12913 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRJQ12913 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRJQ12913 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRJQ12913 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRJQ12913 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRJQ12913 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRJQ12913 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRJQ12913 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRJQ12913 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRJQ12913 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRJQ12913 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRJQ12913 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRJQ12913 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRJQ12913 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRJQ12913 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRJQ12913 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRJQ12913 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRJQ12913 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRJQ12913 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRJQ12913 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRJQ12913 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRJQ12913 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTPRJQ12913 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTPRJQ12913 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRJQ12913 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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PTPRJQ12913 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRJQ12913 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC15.07■□□□□ 0
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PTPRJQ12913 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRJQ12913 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRJQ12913 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRJQ12913 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRJQ12913 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRJQ12913 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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PTPRJQ12913 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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PTPRJQ12913 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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PTPRJQ12913 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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PTPRJQ12913 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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PTPRJQ12913 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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PTPRJQ12913 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRJQ12913 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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