Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 FAM155A-201ENST00000375915 8503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 MYO1C-201ENST00000359786 5145 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 EBF2-203ENST00000520164 5145 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 SPTB-202ENST00000389720 6321 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 CACNA1G-219ENST00000507609 6849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 AL357673.2-201ENST00000623663 4969 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 PTCD1-201ENST00000292478 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 ROBO1-212ENST00000618833 7492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 CAMKK2-205ENST00000392474 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC9.38□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
SYCNQ0VAF6 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms