Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABPAQ06546 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GABPAQ06546 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms