Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP1Q00587 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms