Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD3P84022 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD3P84022 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD3P84022 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD3P84022 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMAD3P84022 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD3P84022 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD3P84022 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD3P84022 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD3P84022 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMAD3P84022 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD3P84022 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD3P84022 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD3P84022 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMAD3P84022 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SMAD3P84022 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SMAD3P84022 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMAD3P84022 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMAD3P84022 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SMAD3P84022 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SMAD3P84022 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMAD3P84022 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SMAD3P84022 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SMAD3P84022 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SMAD3P84022 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SMAD3P84022 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMAD3P84022 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMAD3P84022 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMAD3P84022 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SMAD3P84022 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD3P84022 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD3P84022 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD3P84022 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD3P84022 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD3P84022 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD3P84022 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD3P84022 AL359458.1-201ENST00000430821 400 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD3P84022 AL954722.1-201ENST00000431238 259 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMAD3P84022 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMAD3P84022 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD3P84022 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD3P84022 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD3P84022 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD3P84022 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD3P84022 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD3P84022 NAT9-219ENST00000582524 573 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD3P84022 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD3P84022 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD3P84022 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD3P84022 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD3P84022 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD3P84022 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD3P84022 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD3P84022 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD3P84022 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD3P84022 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD3P84022 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD3P84022 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD3P84022 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD3P84022 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD3P84022 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD3P84022 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD3P84022 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD3P84022 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD3P84022 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMAD3P84022 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD3P84022 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD3P84022 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD3P84022 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD3P84022 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD3P84022 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD3P84022 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD3P84022 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD3P84022 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD3P84022 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD3P84022 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD3P84022 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD3P84022 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD3P84022 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD3P84022 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD3P84022 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD3P84022 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMAD3P84022 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD3P84022 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD3P84022 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD3P84022 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD3P84022 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD3P84022 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMAD3P84022 KRT8P6-201ENST00000399259 1207 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMAD3P84022 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMAD3P84022 AC011239.1-201ENST00000430988 584 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD3P84022 LINC01824-201ENST00000436082 528 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD3P84022 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMAD3P84022 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD3P84022 IGKV1OR2-108-201ENST00000453673 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD3P84022 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMAD3P84022 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMAD3P84022 AC087072.1-201ENST00000603727 421 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMAD3P84022 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMAD3P84022 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms