Protein–RNA interactions for Protein: P78504

JAG1, Protein jagged-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAG1P78504 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAG1P78504 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAG1P78504 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
JAG1P78504 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAG1P78504 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAG1P78504 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAG1P78504 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAG1P78504 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAG1P78504 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAG1P78504 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAG1P78504 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAG1P78504 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAG1P78504 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAG1P78504 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAG1P78504 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAG1P78504 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAG1P78504 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAG1P78504 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAG1P78504 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAG1P78504 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAG1P78504 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAG1P78504 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAG1P78504 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAG1P78504 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAG1P78504 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAG1P78504 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAG1P78504 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
JAG1P78504 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAG1P78504 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
JAG1P78504 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAG1P78504 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAG1P78504 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAG1P78504 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
JAG1P78504 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
JAG1P78504 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAG1P78504 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
JAG1P78504 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAG1P78504 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAG1P78504 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAG1P78504 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAG1P78504 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAG1P78504 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAG1P78504 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAG1P78504 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAG1P78504 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAG1P78504 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAG1P78504 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAG1P78504 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAG1P78504 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAG1P78504 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JAG1P78504 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
JAG1P78504 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JAG1P78504 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JAG1P78504 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JAG1P78504 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JAG1P78504 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JAG1P78504 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JAG1P78504 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JAG1P78504 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JAG1P78504 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
JAG1P78504 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JAG1P78504 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JAG1P78504 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JAG1P78504 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JAG1P78504 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JAG1P78504 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JAG1P78504 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JAG1P78504 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JAG1P78504 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JAG1P78504 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JAG1P78504 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JAG1P78504 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JAG1P78504 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JAG1P78504 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JAG1P78504 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JAG1P78504 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JAG1P78504 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
JAG1P78504 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
JAG1P78504 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JAG1P78504 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JAG1P78504 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JAG1P78504 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JAG1P78504 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JAG1P78504 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JAG1P78504 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JAG1P78504 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JAG1P78504 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JAG1P78504 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JAG1P78504 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JAG1P78504 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JAG1P78504 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JAG1P78504 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JAG1P78504 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JAG1P78504 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JAG1P78504 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JAG1P78504 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JAG1P78504 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JAG1P78504 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
JAG1P78504 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JAG1P78504 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms