Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SKP1P63208 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SKP1P63208 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SKP1P63208 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SKP1P63208 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SKP1P63208 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SKP1P63208 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SKP1P63208 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SKP1P63208 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SKP1P63208 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SKP1P63208 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SKP1P63208 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SKP1P63208 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SKP1P63208 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SKP1P63208 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SKP1P63208 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SKP1P63208 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SKP1P63208 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SKP1P63208 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SKP1P63208 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SKP1P63208 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SKP1P63208 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SKP1P63208 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SKP1P63208 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SKP1P63208 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SKP1P63208 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SKP1P63208 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SKP1P63208 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SKP1P63208 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SKP1P63208 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SKP1P63208 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SKP1P63208 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SKP1P63208 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SKP1P63208 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SKP1P63208 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SKP1P63208 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SKP1P63208 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SKP1P63208 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SKP1P63208 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SKP1P63208 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SKP1P63208 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms