Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 HYOU1-217ENST00000612687 4360 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 SLC36A1-201ENST00000243389 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 C15orf40-201ENST00000304177 11244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 FER1L5-207ENST00000641731 6294 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 HSPA12A-201ENST00000369209 5722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 ESPL1-205ENST00000552462 6447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 FBXW8-202ENST00000455858 4648 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 HERC2P10-201ENST00000570209 2393 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 ABCC3-201ENST00000285238 5716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 SYK-204ENST00000375754 5005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 NRAP-201ENST00000359988 5580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 OR4K13-203ENST00000641904 5684 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 TPX2-202ENST00000340513 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 DLEC1-201ENST00000308059 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms