Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 ST8SIA1-203ENST00000396037 9714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
ACTBP60709 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ACTBP60709 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ACTBP60709 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ACTBP60709 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ACTBP60709 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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ACTBP60709 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ACTBP60709 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ACTBP60709 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ACTBP60709 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ACTBP60709 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ACTBP60709 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ACTBP60709 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ACTBP60709 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ACTBP60709 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ACTBP60709 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ACTBP60709 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ACTBP60709 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ACTBP60709 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ACTBP60709 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ACTBP60709 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ACTBP60709 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ACTBP60709 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ACTBP60709 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ACTBP60709 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ACTBP60709 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ACTBP60709 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ACTBP60709 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ACTBP60709 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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