Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 DDO-201ENST00000368923 1953 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 PNPLA8-208ENST00000453144 3366 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 FLNA-202ENST00000360319 8281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 SLC6A19-201ENST00000304460 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 MAP1A-201ENST00000300231 10258 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 NBN-201ENST00000265433 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 PARP3-202ENST00000417220 2472 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SH3BGRP55822 MEGF8-202ENST00000334370 10966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 PER1-211ENST00000581082 4521 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 ATP7B-202ENST00000344297 5861 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 LINC00656-201ENST00000443744 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 UBTFL8-201ENST00000426903 2112 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 CSPG4P13-202ENST00000567704 4801 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 LRRC8A-201ENST00000259324 4619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 FAM131B-203ENST00000409408 5856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 NKAP-201ENST00000371410 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 USP20-201ENST00000315480 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 XIRP1-201ENST00000340369 6460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SH3BGRP55822 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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