Protein–RNA interactions for Protein: P35499

SCN4A, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4AP35499 AL357079.1-203ENST00000412378 494 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 PHBP3-201ENST00000412562 819 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 GOSR1-205ENST00000467337 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 AC067942.1-202ENST00000471756 1057 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 RPL30P11-202ENST00000509114 358 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 AC092284.1-201ENST00000511386 1289 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 NAA60-236ENST00000577013 575 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 MIR378I-201ENST00000582688 76 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 CD74-201ENST00000009530 981 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 KIAA0391-211ENST00000605870 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 ZNF33A-205ENST00000469037 1530 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 GMEB1-201ENST00000294409 1912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 AL356583.3-201ENST00000412354 417 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 NR1I3-210ENST00000437437 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 AC010677.1-201ENST00000441690 412 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 AC105446.1-201ENST00000441882 407 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 AC139795.1-201ENST00000499314 838 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 AL136360.2-201ENST00000502636 581 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 AC090825.2-201ENST00000557959 739 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 AC103810.4-201ENST00000578601 257 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 SERPIND1-202ENST00000406799 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 AL356583.1-201ENST00000398739 1371 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 AL139424.2-202ENST00000641335 1369 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 LINC00910-201ENST00000341011 2303 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 CALU-202ENST00000449187 2438 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 ARF4-201ENST00000303436 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 ABCD3-201ENST00000315713 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 AL589666.1-201ENST00000503906 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 LINC02507-201ENST00000509370 1028 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 AC022447.2-201ENST00000509750 543 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 CCDC42-202ENST00000539522 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 SNHG21-205ENST00000561107 790 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 AL117379.1-201ENST00000619319 677 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 AC010335.3-201ENST00000623767 531 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 AC138430.2-201ENST00000624068 504 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 LINC02154-201ENST00000412485 1497 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 ECM1-203ENST00000369049 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 MRPS16P3-201ENST00000415961 374 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 RN7SL148P-201ENST00000467120 279 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 IGHV7-56-201ENST00000518372 351 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 SLC25A3-212ENST00000549338 1285 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 PEBP1P1-201ENST00000554856 510 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCN4AP35499 SNRPN-208ENST00000577565 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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