Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
XBP1P17861 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
XBP1P17861 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
XBP1P17861 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
XBP1P17861 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
XBP1P17861 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
XBP1P17861 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
XBP1P17861 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
XBP1P17861 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
XBP1P17861 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
XBP1P17861 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
XBP1P17861 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
XBP1P17861 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
XBP1P17861 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
XBP1P17861 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
XBP1P17861 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
XBP1P17861 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
XBP1P17861 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
XBP1P17861 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
XBP1P17861 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
XBP1P17861 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
XBP1P17861 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
XBP1P17861 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
XBP1P17861 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
XBP1P17861 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
XBP1P17861 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
XBP1P17861 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
XBP1P17861 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
XBP1P17861 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
XBP1P17861 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
XBP1P17861 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
XBP1P17861 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
XBP1P17861 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
XBP1P17861 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
XBP1P17861 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
XBP1P17861 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
XBP1P17861 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
XBP1P17861 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
XBP1P17861 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
XBP1P17861 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
XBP1P17861 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
XBP1P17861 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
XBP1P17861 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
XBP1P17861 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
XBP1P17861 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
XBP1P17861 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
XBP1P17861 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
XBP1P17861 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
XBP1P17861 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
XBP1P17861 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
XBP1P17861 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
XBP1P17861 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
XBP1P17861 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
XBP1P17861 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
XBP1P17861 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
XBP1P17861 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
XBP1P17861 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
XBP1P17861 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
XBP1P17861 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
XBP1P17861 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
XBP1P17861 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
XBP1P17861 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
XBP1P17861 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
XBP1P17861 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
XBP1P17861 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
XBP1P17861 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
XBP1P17861 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
XBP1P17861 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
XBP1P17861 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
XBP1P17861 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
XBP1P17861 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
XBP1P17861 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
XBP1P17861 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
XBP1P17861 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
XBP1P17861 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
XBP1P17861 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
XBP1P17861 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
XBP1P17861 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
XBP1P17861 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
XBP1P17861 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
XBP1P17861 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
XBP1P17861 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
XBP1P17861 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
XBP1P17861 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
XBP1P17861 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
XBP1P17861 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
XBP1P17861 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
XBP1P17861 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
XBP1P17861 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
XBP1P17861 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
XBP1P17861 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
XBP1P17861 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
XBP1P17861 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
XBP1P17861 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
XBP1P17861 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
XBP1P17861 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
XBP1P17861 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
XBP1P17861 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
XBP1P17861 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
XBP1P17861 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms