Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SYN1P17600 AC113398.1-201ENST00000464124 406 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SYN1P17600 STAU2-212ENST00000521419 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYN1P17600 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SYN1P17600 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYN1P17600 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYN1P17600 AC005736.3-201ENST00000571169 244 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SYN1P17600 SEPT4-AS1-203ENST00000580769 1000 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SYN1P17600 RN7SL202P-201ENST00000584410 262 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SYN1P17600 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SYN1P17600 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SYN1P17600 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SYN1P17600 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SYN1P17600 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SYN1P17600 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYN1P17600 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SYN1P17600 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SYN1P17600 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYN1P17600 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYN1P17600 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYN1P17600 SFPQP1-201ENST00000446621 1786 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SYN1P17600 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYN1P17600 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYN1P17600 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYN1P17600 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SYN1P17600 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SYN1P17600 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYN1P17600 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYN1P17600 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYN1P17600 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SYN1P17600 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYN1P17600 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYN1P17600 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYN1P17600 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYN1P17600 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYN1P17600 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYN1P17600 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYN1P17600 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SYN1P17600 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYN1P17600 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYN1P17600 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYN1P17600 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYN1P17600 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYN1P17600 HIGD2B-201ENST00000311755 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYN1P17600 COA6-201ENST00000366612 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYN1P17600 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SYN1P17600 MIR193A-201ENST00000384882 88 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SYN1P17600 AL627095.1-201ENST00000414775 321 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SYN1P17600 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SYN1P17600 AC007881.1-201ENST00000437460 187 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SYN1P17600 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SYN1P17600 RRNAD1-204ENST00000476229 1096 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SYN1P17600 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYN1P17600 AP001107.9-202ENST00000531602 613 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYN1P17600 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYN1P17600 AL136298.3-201ENST00000556746 445 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SYN1P17600 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SYN1P17600 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SYN1P17600 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYN1P17600 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYN1P17600 AC015912.3-201ENST00000619432 348 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SYN1P17600 PAX8-AS1-219ENST00000623306 840 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SYN1P17600 PAX6-238ENST00000638755 1161 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SYN1P17600 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYN1P17600 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYN1P17600 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYN1P17600 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYN1P17600 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYN1P17600 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYN1P17600 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYN1P17600 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SYN1P17600 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYN1P17600 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYN1P17600 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYN1P17600 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYN1P17600 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYN1P17600 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYN1P17600 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYN1P17600 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SYN1P17600 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SYN1P17600 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYN1P17600 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYN1P17600 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SYN1P17600 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYN1P17600 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYN1P17600 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYN1P17600 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SYN1P17600 TRMT11-202ENST00000368332 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SYN1P17600 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYN1P17600 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SYN1P17600 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SYN1P17600 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SYN1P17600 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYN1P17600 EDF1-201ENST00000224073 640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYN1P17600 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYN1P17600 SUMO1-202ENST00000392245 1071 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SYN1P17600 AC074019.1-201ENST00000428788 1096 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SYN1P17600 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYN1P17600 SRP9P1-201ENST00000445874 261 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SYN1P17600 OR2A1-AS1-203ENST00000468575 568 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms