Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP2A2P16615 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms