Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIP12755 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIP12755 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIP12755 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIP12755 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIP12755 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIP12755 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIP12755 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIP12755 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIP12755 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIP12755 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIP12755 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIP12755 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIP12755 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIP12755 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIP12755 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIP12755 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIP12755 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIP12755 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIP12755 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIP12755 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIP12755 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKIP12755 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIP12755 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIP12755 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIP12755 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIP12755 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIP12755 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIP12755 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIP12755 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIP12755 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIP12755 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIP12755 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIP12755 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIP12755 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIP12755 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIP12755 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIP12755 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIP12755 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIP12755 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIP12755 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIP12755 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIP12755 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIP12755 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIP12755 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIP12755 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIP12755 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIP12755 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIP12755 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIP12755 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIP12755 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIP12755 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIP12755 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIP12755 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIP12755 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIP12755 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIP12755 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIP12755 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIP12755 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIP12755 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIP12755 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIP12755 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIP12755 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIP12755 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIP12755 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIP12755 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIP12755 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIP12755 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIP12755 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKIP12755 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIP12755 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIP12755 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIP12755 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIP12755 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIP12755 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIP12755 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIP12755 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIP12755 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIP12755 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIP12755 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIP12755 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIP12755 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIP12755 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIP12755 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIP12755 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIP12755 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIP12755 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIP12755 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIP12755 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIP12755 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIP12755 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIP12755 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIP12755 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIP12755 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIP12755 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIP12755 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIP12755 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIP12755 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIP12755 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIP12755 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms